工程款记入的会计科目需根据业务性质和结算阶段进行区分，具体如下：
一、收到工程款时的会计处理
未开发票时 借： 银行存款
贷： 工程结算-工程进度款
说明：此时款项已实际收到，但尚未提供发票，因此暂挂于"应收账款"科目。
已开发票时
借： 银行存款
贷： 主营业务收入
应交税费-应交增值税（销项税）
说明：款项已收到且已开具发票，收入确认的同时需结转增值税。
二、支付工程款时的会计处理
支付在建工程款项
借： 在建工程
应交税费-应交增值税（进项税额）
贷： 银行存款
说明：用于工程建设的支出，通过"在建工程"科目核算。
支付其他费用（如材料、劳务）
借： 应付工资/库存材料
贷： 银行存款
说明：支付给供应商的直接费用，计入相关成本科目。
三、工程完工后的处理
工程完工且达到可使用状态
借： 固定资产
贷： 在建工程
说明：将"在建工程"转入"固定资产"科目。
工程完工结算
借： 工程结算
贷： 应付工程款（或"银行存款"）
说明：根据工程进度结算单对冲"工程施工"科目余额。
四、注意事项
发票管理： 开发票是收入确认和增值税抵扣的关键依据，需及时开具。 科目设置
税务合规：不同地区对工程款的增值税税率可能不同，需根据具体政策执行。
通过以上分阶段处理，可确保工程款核算的准确性和合规性。