哈尔滨工程大学的第二学历学分计算方式如下：
学分获取途径 
第二学历可通过两种方式获得：
- 全日制辅修：
在校生在修读主专业的同时修读第二专业，学分与本校学历同层次。 - 非全日制学历：包括成人教育（业余/函授）、自考、电大、远程教育等，学分与本校学历同层次。
学分计算规则 
- 基础课程：
每学期课程学分固定（如高等数学3.5分、体育1分），及格后获得相应学分，补考通过仍计1分，重修后按正常成绩计1分。 - 选修课要求：理工类专业需修满经济管理与法律、人文与艺术类选修课至少6学分。
总学分要求 - 本科阶段：
总学分需≥160分，其中专业课程≥120分，选修课≥40分。 - 在职研究生：总学分≥33分，课程学分≥30分，科研/学术活动各1分，教学与社会实践1分。
绩点计算
GPA=（∑课程绩点×课程学分）/∑课程学分，重修学分不计入绩点。
说明：
第二学历与本校学历在层次、学分计算规则上保持一致，不影响升学或毕业要求。