关于免税农产品的增值税抵扣，需根据采购来源和用途进行具体处理，主要规则如下：
一、抵扣条件与发票要求
取得增值税专用发票 从一般纳税人处取得增值税专用发票（如销售发票、收购发票）或海关进口增值税专用缴款书，可按发票注明的增值税额直接抵扣。
取得免税农产品销售发票或收购发票
- 自产自销农产品： 按买价的9%计算抵扣，生产领用时可加计1%。 - 免税农产品销售发票
特殊情形
- 小规模纳税人提供的3%征收率发票，可按9%扣除率计算抵扣。
二、不同采购渠道的抵扣规则
直接从农业生产者处采购
按买价的9%计算抵扣，生产13%税率产品时可加计1%。
通过批发零售环节采购
蔬菜、鲜活肉蛋等免税农产品，无论用途均按3%征收率计算抵扣，不可加计。
进口农产品
以海关进口增值税专用缴款书注明的增值税额抵扣。
三、混合用途的特殊处理
若农产品既用于生产13%税率货物又用于其他用途：
凭专用发票或海关缴款书注明的增值税额抵扣；
或按买价和9%扣除率计算抵扣。
四、注意事项
扣除率调整
2019年4月1日起，农产品扣除率由13%降至9%，部分早期政策文件中提到的11%已过时。
免税范围限制
农产品免税政策仅适用于农业生产者销售的自产产品，外购农产品或加工后销售的产品需正常纳税。
账务处理示例
例如：
- 购进免税农产品100万元，可抵扣进项税额=100万×9%=9万元；
- 生产13%税率产品时，领用部分需加计1%抵扣。
五、政策依据与调整
相关税率调整以国务院最新规定为准，例如2017年简并增值税税率后，扣除率统一降至9%。企业需关注财税政策变化，确保合规操作。
以上规则综合了增值税法及近年政策调整，具体应用时需结合业务场景确认适用条款。