根据权威信息源，成为舰长需在军校系统接受专业训练，主要专业选择如下：
一、核心专业：水面舰艇指挥专业
该专业是海军舰艇指挥军官的摇篮，涵盖航海、观通、枪炮、导弹等通科知识，为舰长岗位提供全面能力培养。
二、技术支持类专业
航海技术：
基础航海技能与船舶操作，是舰长必备的核心专业。
通信工程/电子信息工程：
保障舰队通信与信息化作战能力。
武器系统与工程：
管理舰载武器系统，属于舰长职责的重要部分。
三、辅助专业（根据兴趣选择）
军事海洋学：研究海洋环境对海军行动的影响，提升作战适应性。
电子对抗：掌握信息对抗技术，增强舰艇防御能力。
四、其他相关领域
轮机工程：维护舰艇动力系统，保障航行安全。
管理科学与工程：适合未来转向管理或法务工作。
建议：优先选择水面舰艇指挥专业，并辅修航海技术、通信工程等核心课程。若对技术方向更感兴趣，可结合武器系统与工程等专业。