福清市目前有以下高职院校：
福建技术师范学院 
- 公办本科高校，2002年本科办学，以职业教育师资培养为特色，设有13个二级学院、39个本科专业，全日制在校生1.2万人。
福清高等医学专科学校
- 五年制大专，专业涵盖临床医学、预防医学等，注重医学技能培养。
福清农业职业技术学院（福清农业技术学院）
- 福建省唯一农业类高职，提供农业技术、园艺技术等专业，服务地方农业发展。
福清市职业技术学校
- 市属重点高职，整合了原福清市职业技术学校与高山育才中学职高部资源，开设建筑工程技术、电子商务等专业。
福清华夏职业技术学校
- 以应用型技能培训为主，涵盖机械加工、电子应用等专业，注重校企合作。
说明：
福建师范大学福清分校为本科院校，未列入高职名单。- 其他学校如龙华职专、澳华语言职校等为中等职业学校，非高职层次。