根据搜索结果，魔法学院顶楼可通过以下方式进入，具体路径因区域而异：
魔法学院主屋顶入口 - 位于中心城市，通过大厅进入后，直接跳至魔法学院主屋顶区域，可探索广阔的屋顶区并收集黄金种子等道具。
钟楼入口（需解谜）
- 在中心城市大厅找到通往钟楼的入口，需通过图书馆书架间的隐藏机关秘道进入。与院长对话后获得“时间之钥”，但需注意钟楼内部复杂机械结构，需逐步解锁楼梯间才能到达顶层。
特定区域斜坡屋顶（如终焉之马格诺利亚）
- 在终焉之马格诺利亚区域，可通过另一侧斜坡屋顶进入魔法学院。需注意身体轻盈和跳跃能力，部分核心收集需提前准备减CD护符。
注意事项：
不同区域的顶楼入口和路径设计差异较大，建议结合具体场景选择合适方式。若遇到高难度机关（如钟楼），可参考权威攻略视频辅助探索。