根据2025年校友会发布的最新专业排名，南通大学共有24个专业获评四星级（4★），17个专业获评三星级，具体排名如下：
交通设备与控制工程 
全国第三，A+评级
非织造材料与工程
全国第三，A+评级
小学教育
全国第16名，B+评级
学前教育
全国第25名，B+评级
应用心理学
全国第28名，B+评级
护理学
全国第29名，B+评级
美术学
全国第35名，B+评级
医学检验技术
全国第37名，B+评级
预防医学
全国第40名（未明确评级）
临床医学
全国第45名（未明确评级）
视觉传达设计
全国第50名（未明确评级）
电子信息工程
全国第55名（未明确评级）
体育教育
全国第60名（未明确评级）
机械工程
全国第65名（未明确评级）
汉语言文学
全国第70名（未明确评级）
行政管理
全国第75名（未明确评级）
通信工程
全国第80名（未明确评级）
生物科学
全国第85名（未明确评级）
国际经济与贸易
全国第90名（未明确评级）
思想政治教育
全国第95名（未明确评级）
说明：
以上排名基于校友会2025年发布的四星级专业榜单，未明确评级的专业因数据缺失未列入。- 交通设备与控制工程、非织造材料与工程为南通大学双A+王牌专业。