全国开设水务工程专业的大学共有12所，具体名单如下（按最新权威信息整合）：
河北工程大学 
位于河北省，以工学为主，多学科协调发展，是湖北省“双一流”建设高校。
河海大学
江苏省重点高校，水务工程领域权威性强，科研实力突出。
华北水利水电大学
河南省重点院校，水利水电领域特色鲜明，全国排名前列。
厦门理工学院
福建省高校，学科门类齐全，水务工程专业发展稳定。
皖江工学院
安徽省民办本科高校，前身为河海大学文天学院，地理位置优越。
武汉大学
湖北省重点综合性大学，多学科交叉融合，水务工程领域实力强劲。
湖北工业大学
湖北省“双一流”高校，工科特色突出，就业前景良好。
湖南工业大学
湖南省重点高校，注重实践与创新，水务工程专业逐步发展。
华南理工大学
广东省重点理工类高校，学科建设全面，水务工程领域竞争力强。
云南农业大学
云南省高校，结合农业与水利，水务工程应用特色鲜明。
昆明理工大学津桥学院
昆明市属高校，依托母体学校资源，水务工程专业稳步提升。
说明：
以上名单综合了多份权威来源，包含综合排名、学科特色及地理位置等维度。实际招生以各校最新信息为准。