截至2025年2月，复旦大学共拥有 18家附属医院，具体分类如下：
综合医院
- 复旦大学附属中山医院
- 复旦大学附属华山医院
- 复旦大学附属华东医院
- 复旦大学附属金山医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属公共卫生临床中心
- 复旦大学附属质子重离子医院
- 复旦大学附属精卫中心（筹）
专科医院
- 复旦大学附属肿瘤医院
- 复旦大学附属儿科医院
- 复旦大学附属妇产科医院
- 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
- 复旦大学附属公共卫生临床中心
- 复旦大学附属质子重离子医院
- 复旦大学附属精卫中心（筹）
区级医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
- 复旦大学附属第五人民医院
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