关于中国"双非"高校的排名，不同评价机构存在差异，以下是综合多个权威来源的排名情况：
一、2021年软科中国大学排名（双非层次）
南方科技大学 （41名） 在"双非"高校中综合实力最强，尤其在科研、学术人才和办学资源方面表现突出，超越了多所传统顶尖高校。
上海科技大学
（66名）
由中科院联合创办，科研实力强劲，2021年QS世界大学排名323位，与西安交通大学、天津大学相当。
深圳大学（70名）
深圳市重点建设高校，2021年QS排名281位，依托深圳创新资源优势发展。
二、2022年校友会中国双非大学排名
上海科技大学（58名）
综合实力稳居前五，科研项目与产业结合紧密。
南方科技大学（未明确，但位列前30强）
持续保持高增长态势，多指标超越传统985高校。
华南农业大学（54名）
农业与工科领域突出，校友会排名第五。
三、2023年双一流中的"双非"院校排名
南方科技大学（第4名）
在双一流建设高校中表现优异，但未入选首批"双一流"。
上海科技大学（第3名）
同样未入选首批"双一流"，但综合实力居前列。
湘潭大学（未明确，但排名垫底）
作为985/211高校，未进入双非前30强。
四、其他关键信息
南方科技大学： 2021年QS世界排名323位，亚洲排名第八，师资规模达1300人，含55位院士。
上海科技大学：2013年中科院与上海市政府联合创办，2018年获批博士授权。
深圳大学：2021年QS排名281位，深圳本地高校中综合实力最强。
总结
南方科技大学和上海科技大学是当前"双非"高校中综合实力最强的两所，南方科技大学在科研和国际化指标上表现突出，上海科技大学则依托中科院背景在科研领域优势显著。其他高校如深圳大学、华南农业大学等也在特定领域具有竞争力。