关于清朝时期大学的数量，由于历史统计口径和定义差异，不同来源存在较大差异。综合多个信息源，可总结如下：
一、政府创办的国立大学
京师大学堂 （1898年） 中国近代第一所国立大学，北京大学前身。
北洋大学堂
（1895年）
中国第一所近代大学，天津大学前身。
南洋公学（1896年）
中国历史最悠久的高等学府之一，上海交通大学前身。
山西大学堂（1902年）
与京师大学堂、北洋大学堂并称中国最早三所大学堂之一。
福建船政学堂（1866年）
中国近代海军人才培养摇篮。
二、其他重要院校
天津西医学堂（1895年）
武昌文华图书馆专科学校（1902年）
湖北武昌高等师范学校（1913年）
燕京大学（1898年）
岭南大学（1888年）。
三、教会大学
晚清时期，基督教团体创办了多所大学，如圣约翰大学、燕京大学、华中大学等。
四、数量争议
官方统计： 清政府官方文件中提到的国立大学多所。 综合估算
总结
清朝时期大学数量存在不同统计口径，若以政府创办的国立大学为核心，至少有8-12所；若包含私立及教会大学，则总数超过20所。重要机构如京师大学堂、北洋大学堂等均对后世影响深远。