清朝时期共建立约20多所大学，其中以国立大学和教会大学为主。以下是主要分类及代表机构：
国立大学 - 京师大学堂
（1898年）：中国近代第一所国立大学，北京大学前身。 - 北洋大学堂（1895年）：中国第一所近代大学，天津大学前身。 - 四川高等学堂（1902年）：四川大学前身。 - 清华大学（1911年）：清政府创立的留美预备学校，后发展为国立清华大学。2. 教会大学
晚清时期基督教机构创办的大学，如圣约翰大学、燕京大学、金陵大学等，共17所。3. 其他重要院校
- 上海交通大学（前身为1896年南洋公学）。 - 武汉大学（前身为1893年自强学堂）。 - 东南大学（1902年成立，利用庚子赔款资金）。 说明：
不同来源对大学数量的统计存在差异，主要因分类标准（如是否为国立、是否包含教会大学）不同。上述信息综合自权威性较高的来源。