根据搜索结果，邓小琪在《少年派2》中未被录取艺术学院的原因可归纳为以下几点：
专业能力不足
尽管邓小琪外貌出众且通过艺考进入艺术院校，但实际表演中暴露出理解力、想象力和表现力的严重缺陷。导演沈乔华在试镜中明确指出，演员需同时具备“理解力、想象力、表现力”三大素质，而邓小琪在这三方面均表现不佳。例如，她对剧本的解读肤浅，台词表演浮夸且脱离角色，甚至被导演作为反面教材。
职业规划与现实选择
邓小琪曾计划留在北京发展，但最终因母亲建议回江州话剧院，追求圈内导演沈乔华的指导机会。这一职业选择表明她更重视行业资源而非个人发展潜力，可能间接影响了她的学习态度和表现。
情感因素干扰
邓小琪与江天昊的关系复杂。江天昊虽对邓小琪有长期感情，但邓小琪因江天昊“三无人员”身份（无高学历、不自觉学习、家庭背景普通）而多次拒绝其追求。这种情感纠葛可能分散了她的学习精力，导致她未能充分准备艺考。
综上，邓小琪未被录取的主要原因是专业能力未达艺术院校要求，同时职业规划和情感因素也起到了推动作用。