二进制在编程和理解上的难度主要源于其独特的进制特性和与计算机硬件的紧密关联，具体原因如下：
进制特性导致可读性差
二进制仅由0和1组成，位数扩展后（如int类型4字节）会导致代码冗长且难以直观理解。例如，十进制数3在二进制中为`0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0011`，长串字符增加了阅读和编写的复杂性。
与硬件实现的直接关联
计算机硬件基于逻辑门（如与门、或门）工作，二进制（0和1）天然适配这种“开/关”模式。这种底层物理实现方式限制了人类对二进制的直观感知，使其更像一种技术符号而非自然计数系统。
缺乏数学运算的直观性
十进制等更高进制在数学运算中更符合人类习惯（如加法、减法等），而二进制运算（如逢2进1）需要额外理解进制转换规则，增加了计算和调试的难度。
编程语言的抽象层
现代编程语言（如C/C++、Python）通过高级语法屏蔽了二进制细节，开发者无需直接处理内存地址和位操作，从而降低了使用门槛。但初学者仍需通过类比（如十进制与二进制的对应关系）逐步适应。
综上，二进制的“难”源于其与计算机硬件的物理本质绑定，以及人类对自然进制的认知习惯。通过编程语言的抽象和类比工具，可以有效缓解这一难点。