教育机构公司纳税需遵循以下步骤和注意事项，综合多个权威信息源整理如下：
一、主要税种及税率
增值税 - 教育服务通常适用 6%
的税率；
- 若年应税销售额不足500万元，可选择按 3%的征收率计算；
- 提供非学历教育服务可适用 3%的征收率。
企业所得税
- 一般企业税率为 25%，计算公式为：
$$应纳税额 = (收入 - 成本 - 费用) times 25%$$
- 教育机构可享受高新技术企业或小型微利企业税收优惠。
附加税费
- 城市维护建设税： 按增值税额的7%（市区）或5%（县城/建制镇）缴纳； - 教育费附加
个人所得税 
- 员工工资薪金按 7000元/月
起征点缴纳，超过部分适用累进税率。
二、纳税流程与规范
税务登记
- 公司注册后需在税务局办理税务登记，领取税务登记证。
发票管理
- 依法开具增值税专用发票或普通发票，保存完整购进凭证。
申报纳税
- 按月或按季申报增值税和企业所得税，通过电子税务局提交申报表。
优惠政策申报
- 符合条件者可申报教育费附加减免、高新技术企业优惠等。
三、其他注意事项
印花税： 合同、收据按金额的0.05%-0.5%缴纳；
城建税：随增值税额计算，税率同附加税费；
特殊情形：非学历教育服务、托儿所/幼儿园服务免征增值税。
四、建议
建议教育机构定期咨询税务机关或专业记账公司，确保合规操作。例如，佛山高明区注册公司可通过电子税务局实现“一站式”申报，南沙区则提供全程代办服务。税收政策可能动态调整，需以最新规定为准。