截至2023年，广州市南沙区共有 14所初中学校，具体分类如下：
一、公办初中
广州外国语学校（南沙） 全国首批七所外国语学校之一，广州市首批示范性高中，面向全市招生。
广州第二中学南沙天元学校
2019年新增的公办完全中学。
广州市执信中学南沙学校
2019年新增的公办完全中学。
南沙一中
区重点中学，2021年新增的公办学校。
南沙华附（华南师范大学附属南沙中学）
2015年由南沙区与高校合作办学的寄宿制完全中学。
其他公办学校
包括南沙麒麟中学、黄阁中学、大岗中学、第二中学、英东中学、新垦学校、横沥镇中学、珠江中学、东涌中学、鱼窝头中学等。
二、民办初中
英东中学
2019年新增的民办学校，2023年因跨区报名人数超计划实行电脑派位。
新徽学校
2019年新增的民办学校。
芦湾新徽学校
2019年新增的民办学校。
南外实验学校
2019年新增的九年制民办学校。
朝阳学校
2023年新增的民办学校，跨区报名人数超计划。
三、其他说明
十二年一贯制学校： 如南沙第一中学（含初中部），但未单独列出。 数据更新
以上信息综合了2016-2023年官方数据，部分民办学校招生政策可能存在动态调整，建议关注教育局最新通知。