福耀科技大学共设立了八个学院，分别是计算与人工智能学院、智造与未来技术学院、运载与智慧交通学院、新材料与新能源学院、生命与健康科学学院、数字经济与管理学院、文理学院和马克思主义学院。
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这些学院涵盖了广泛的学科领域，包括计算机科学与技术、智能制造工程、车辆工程、材料科学与工程、数字经济与管理、生命与健康科学、文理和马克思主义等。学校实行本硕博贯通的培养模式，致力于培养具有多学科背景、创新能力和国际视野的拔尖创新人才。
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