南京信息工程学院的办学层次需分两种情况说明：
南京信息工程大学（主校区）
- 属于 一本大学，是国家级“双一流”建设高校、江苏省高水平大学建设高校，以大气科学为特色，拥有完整的学士、硕士、博士及博士后教育体系。
- 其前身为1960年成立的南京气象学院，2004年正式更名。
南京信息工程大学滨江学院（独立学院）
- 属于 二本高校，成立于2002年，由南京信息工程大学与基金会联合举办，非主校区办学。
总结：
若指主校区，则为一本院校；若指独立学院，则为二本院校。通常情况下，提及“南京信息工程学院”默认为主校区，即一本大学。