复旦大学和上海交通大学均为中国顶尖高校，综合实力相当，但各有侧重。以下是具体对比：
一、综合排名
校友会排名 - 2024年：复旦大学全国第三，上海交通大学第五。
- 2023年：复旦大学全国第四，上海交通大学第五。
软科中国最好大学排名
- 2023年：复旦大学第三，上海交通大学第四。
- 2022年：上海交通大学第四，复旦大学第五。
QS世界大学排名
- 2023年：复旦大学第四十，上海交通大学第四十七。
- 2021年：复旦大学第三十四，上海交通大学第四十七。
二、学科优势
复旦大学
- 文科与理科： 人文社科（如哲学、经济学、政治学）和基础学科（数学、物理）表现突出，拥有10个A类学科，其中4个A+。 - 医学与公共卫生
上海交通大学 - 工科与医学：
工程、计算机科学、船舶工程等工科领域优势显著，临床医学和材料科学全国顶尖。
- 应用学科：工商管理、管理科学与工程等应用学科发展迅速。
三、师资力量
复旦大学：高级职称教师比例高，博士学位教师占比大，ESI前1%学科中4个进入前1‰。
上海交通大学：院士数量占优（中科院院士27人，工程院院士25人），ESI前1%学科中8个进入前1‰。
四、其他对比
地理位置：两校均位于上海，属于“双子星”高校，竞争与互补并存。
国际认可度：QS、泰晤士等国际榜单中，两校差距较小，但交大在工程类学科国际排名略占优势。
结论：两校综合实力接近，选择时可结合个人专业兴趣。若偏好文理、基础学科或医学，推荐复旦大学；若侧重工科、应用学科或工程领域，上海交通大学更优。