根据权威信息源综合分析，上海交通大学、浙江大学和复旦大学各有优势，具体选择需结合专业方向和城市因素：
一、综合实力对比
浙江大学 - 科研实力：
在国家科技三大奖初评中稳居985高校第五，AI硬件创新大赛夺冠，何梁何利奖入选人数领跑。 - 学科优势：农学、工科领域实力强劲，生态学、控制科学与工程等学科进入ESI前1‰。 - 城市与就业：位于杭州，长三角经济发达，就业资源丰富。
上海交通大学 
- 科研短板：
自然科学奖一等奖零获，ESI前1‰学科仅2个，学科布局存在短板。 - 学科优势：工科（船舶工程、临床医学等）和医学领域突出，金融、管理学科实力强。 - 城市与就业：地处上海，国际化程度高，就业机会多。
复旦大学 - 学科优势：
文理医领域领先，哲学、经济学、政治学等学科国内顶尖，自由选科机制灵活。 - 科研表现：何梁何利奖与清华、浙大并列第二，基础研究与应用研究平衡。 - 城市与就业：位于上海，文化氛围浓厚，适合追求学术自由的学生。
二、专业选择建议
文理医：首选 复旦（学科全面且自由度高）。- 工科：首选 浙大（农学、机械工程等优势突出）。- 医学：浙大和上交大表现均衡，可根据具体专业细分选择。- 城市偏好：上海（交大、复旦）适合国际化发展，杭州（浙大）适合区域经济机会。
三、总结
三校均为顶尖综合性大学，无绝对优劣。若注重科研实力和学科覆盖，浙大更优；若偏好文理医领域或城市资源，复旦、上交大更合适。建议结合个人专业兴趣、城市规划及职业目标综合选择。