复旦大学与上海交通大学各有优势，具体优劣需结合个人专业方向和职业规划判断。以下是综合对比：
一、综合排名与声誉
校友会排名：复旦大学全国第三，上海交通大学第五。
QS世界排名：复旦大学第40位，上海交通大学第47位。
软科综合排名：上海交通大学第4名，复旦大学第5名。
二、学科优势
复旦大学：文科和基础学科突出，拥有23个A类学科（含4个A+学科），数学、物理、文学等领域实力强劲，医学、新闻、国际政治等专业优势明显。
上海交通大学：工科和应用学科见长，25个A类学科（含2个A+学科），船舶工程、电子信息、临床医学等专业全国顶尖，被誉为“东方麻省理工”。
三、师资力量
复旦大学：高级职称教师比例高，博士学位教师占比大，整体师资水平均衡。
上海交通大学：院士数量占优（中科院27人，工程院25人），顶尖科研人才集中，尤其在工程领域优势显著。
四、就业与升学
就业率：上海交通大学总就业率97.87%，出国深造比例73%；复旦大学国内升学、签约就业比例占优。
深造率：上海交通大学33.4%，复旦大学22.36%。
五、文化氛围
复旦大学：学术氛围浓厚，学生综合素质高，社交能力强，毕业生多就职于金融、外企等。
上海交通大学：工程学科背景突出，科研实力强，毕业生多投身国有企业或高新技术企业。
总结建议
选复旦：若侧重人文社科、基础学科或希望在上海本地发展。
选交大：若专注工科、医学或追求国际化发展。