东京大学修士学费因学科和课程类型不同而有所差异，具体如下：
一、国公立大学学费
基础课程学费 - 授课费：535,800日元/年（约合人民币3.4万元）
- 入学金：282,000日元/年（约合人民币1.8万元）
- 总计：第一年约84.78万日元（约合人民币5.3万元），第二年535,800日元（约合人民币3.4万元）
特殊学科学费
- 法科大学院：授课费804,000日元/年（约合人民币5.3万元）
- 夜间课程：学费267,900日元/年（约合人民币1.7万元）
学费调整
- 2025年4月新入学本科生学费上调10万日元，总限额达642,960日元（约合人民币3.2万元）
- 博士课程学费保持不变
二、私立大学学费
文科系：
每年100万至140万日元（约合人民币6.7万至9.8万元）
理工科系：每年140万至180万日元（约合人民币9.8万至12.5万元）
医学类：每年300万至1000万日元（约合人民币18万至55万元）
三、其他费用说明
生活费：每月约6万至10万日元（约合人民币3.6万至6.5万元），含住宿费（1-2万元/年租房或校内宿舍）
总费用估算：国公立大学两年总费用约140万日元（约合人民币8.5万元），私立大学费用差异较大
四、奖学金与减免
东京大学等部分院校提供入学金、学费减免等资助，符合条件的学生可免除学费。具体申请条件需参考各校官方说明。