关于赣州市区最好的学校选择，需结合办学层次、学科优势及区域评价综合判断。以下是综合多个来源的信息分析：
一、重点中学推荐
赣州中学 - 历史最悠久的市重点中学，学科设置完善，教学质量长期位居全市第一。
- 特色班级包括“红色班”和“珍珠班”，注重革命传统与贫困生帮扶。
赣州市第三中学
- 设施先进，师资力量强，高考成绩突出，是另一所重点中学。
赣南师院附中
- 师资雄厚，多学科协调发展，适合注重综合素养培养的学生。
二、其他优质学校
赣州一中： 历史最悠久，学科优势明显，但部分评价认为其综合实力略逊于第三中学。 赣州师范高等专科学校
江西理工大学：理工类重点建设高校，工科实力突出。
三、选择建议
优先考虑重点中学：若追求综合实力和升学优势，赣州中学和第三中学是更稳妥的选择。
结合个人需求：
寄宿制需求可考虑赣中；
医学专业倾向推荐赣南医学院；
综合素质关注南康中学的“红色班”特色。
四、补充说明
不同评价体系存在差异，例如南康中学在2019年高考中600分以上人数居全市第一，而赣州中学近年表现突出。建议结合最新高考数据及学校特色综合判断。