根据搜索结果中不同来源的排名及评价，南通市中学综合实力较强的学校如下：
一、顶尖高中推荐
海安中学 - 优势：
国家级示范性高中，高考成绩突出，2020年一本上线率达98.74%，400分以上133人，连续多年保持全省前列。 - 特色：注重自主学习与创新思维培养，师资力量雄厚。
海门中学 - 优势：
百年名校，江苏省四星级重点高中，2020年一本上线率96.1%，400分以上133人，学科竞赛成绩优异。 - 特色：提供个性化学习指导与丰富选修课程。
如皋中学 - 优势：
江苏省重点中学，2020年一本上线率98.74%，历史底蕴深厚，文化氛围浓厚。 - 特色：注重综合素质培养，毕业生多进入重点高校。
南通中学 - 优势：
江苏省首批省属重点中学，2024年综合排名进入前十，市区优质选择。 - 特色：硬件设施完善，师资力量稳定。
二、其他高口碑学校
如东高级中学：2020年一本上线率96.1%，连续9年江苏省重点中学前列。- 通州高级中学：2024年综合排名进入前十，教学质量稳步提升。- 启东中学：2024年排名有所波动，但仍是区域重点中学。
三、选择建议
优先考虑市区：海安中学、海门中学、如皋中学、南通中学等市区学校资源更丰富。- 关注特色：如需艺术、体育等特长培养，可参考南通大学附属中学等关联资源。以上信息综合自多份中等至高权威性来源，具体选择需结合个人需求及学校实际情况。