医生因学历问题辞职的处理方式需结合具体情况分析，主要分为以下四类情况：
一、学历不符合岗位要求且无过错
若医生入职时单位已明确学历要求（如入职体检、录用通知等文件），且因自身学历不足导致无法胜任工作，属于主动辞职范畴，通常无需赔偿。
二、单位存在过错
1. 招聘时未明确学历要求，或入职后以学历不足为由违法解除劳动合同，医生可主张经济补偿，标准为每满一年支付一个月工资。
2. 单位存在其他违法行为（如未支付工资、社保等），可一并主张经济补偿，计算方式同上。
三、辞职后执业证处理
辞职后若无工作，需按规定办理执业证变更或重新注册：
1. 变更注册：持执业证到原注册地卫生行政部门办理变更手续。
2. 重新执业：辞职超过2年且符合条件者，可向委托机构申请考核并重新注册。
四、特殊情况处理
若涉及编制内医生，辞职可能受政策限制（如服务期未满、考核不合格等），需结合具体合同条款和单位规定处理。建议通过法律途径维护权益，保留沟通记录作为证据。