根据您的问题，申请期限已过后的处理方式需结合具体法律场景分析，以下是常见情形的解决方案：
一、专利申请期限过期
专利权终止 专利申请到期后，若未续展或放弃，专利权将终止，无法续展。 - 外观设计专利权：15年
- 实用新型专利权：10年
- 发明专利权：20年
终止后专利将进入公有领域，他人可自由使用。
补缴年费
若在到期后1个月内补缴年费，无需支付滞纳金，可恢复专利权。
二、劳动争议仲裁时效过期
仲裁申请终止
劳动争议仲裁时效期间为1年，过期后仲裁委员会将不予受理新申请。- 特殊情形处理
若用人单位未在时效内申请仲裁，劳动者可向人民法院提起诉讼，但需承担一定法律后果（如证据不足风险）。
三、民事诉讼时效过期
丧失强制执行权
民事诉讼时效期间通常为3年，过期后法院将不予执行。 - 但若对方未提出异议，法院仍可能执行。
申诉与抗诉
- 再审申请：
超过2年时效，可向检察院申请抗诉（最高检或地方检察院）；
- 其他情形：如法院驳回再审申请、逾期未裁定等，可向检察院申请检察建议。
四、工伤认定申请时效过期
单位责任：用人单位未在1年时效内申请，工伤待遇由单位承担；
个人救济：超过时效后，个人无法通过仲裁或诉讼主张工伤权益，但可要求单位赔偿。
总结建议
及时关注期限：各类申请均有明确时效，建议通过官方渠道查询剩余期限；
特殊情形处理：部分情况下可通过申诉、抗诉等途径突破时效限制，但成功率较低；
法律咨询：复杂案件建议咨询专业律师，避免因时效问题影响权益。