根据搜索结果，崇明区优质学校主要集中在小学和初中阶段，以下是综合推荐：
一、小学推荐
崇明区实验小学 - 特点：
三校区布局，城区总校成绩稳定，教学理念先进，社会认可度高。
东门小学
- 特点： 紧随实验小学之后，三校区体系完善，升学成绩优异。长兴岛分校（上海实验小学长兴分校）
- 特点： 与百年名校合作办学，融入海洋文化教育，注重实践与创新。建中心小学
- 特点： 农村中心小学，设备先进，注重个性化发展。 二、初中推荐东门中学
- 特点： 向崇明中学输送优质生源，教学质量突出。实验中学
- 特点： 中考成绩区内前列，教学管理严谨。上海市实验学校东滩高级中学
- 特点： 新校名校模式，跨区集团化办学，设施先进，注重创新教育。
三、其他特色学校
崇明县第一中学：历史悠久，师资力量强，教学设施完善。
民一中学：优质民办教育资源，教学水平较高。
建议：优先选择城区学校（如实验小学、东门小学），若需跨岛就读可考虑长兴岛分校或东滩高级中学。建议实地考察学校环境及教学质量后再做决定。