关于考研期间已有就业协议的处理，建议参考以下步骤和注意事项：
一、协商解约
提前沟通 尽早向原单位说明考研计划，请求协商解除就业协议。部分单位可能允许灵活处理，尤其对考研等特殊情况持开放态度。
获取解约函
若单位同意解约，需要求其提供加盖公章的书面解约函。
学校备案与档案处理
将解约函提交至学校就业指导中心备案，并根据单位性质办理档案转移：
- 国企：需单位明确告知档案转递方式；
- 私企：档案通常由人社局管理，考研后可直接提档。
二、保留学籍或休学
协议中相关条款
检查协议是否有关于在职考研的条款，部分院校允许协议自动失效或保留学籍。
学校支持政策
部分院校可能提供保留学籍或休学支持，建议与辅导员沟通确认。
三、注意事项
违约金问题
- 若协议中明确约定违约金，且金额合理，可协商分期支付或以其他方式补偿；
- 若协议无效（如自动失效条款），则无需支付违约金。
时间节点
建议在考研成绩公布前完成解约手续，避免影响录取进程。
法律咨询
若协商无果，可咨询劳动仲裁机构或法律专业人士，维护自身权益。
四、替代方案
若无法解除原协议，可考虑以下方案：
签订新协议： 与另一家单位签订就业协议，明确注明“允许在职考研”条款； 灵活就业
总结
考研与就业协议并不矛盾，通过提前沟通、协商解约或利用学校政策，多数情况下可以妥善处理。建议优先保留学籍或休学，减少后顾之忧。