协议就业保证金的税务处理需要根据其性质和用途进行区分，具体说明如下：
一、性质与用途
协议就业保证金是用人单位为保障残疾人就业而缴纳的专项费用，主要用于支持残疾人就业。根据相关法律法规，其性质属于 政府性基金，而非企业所得税或个人所得税的计税依据。
二、与税收的关系
不计入应纳税所得额 协议就业保证金不属于企业的应税收入，因此不参与企业所得税的计算。
无需缴纳增值税
该费用不属于增值税的征税范围，无需开具增值税发票或缴纳增值税。
三、退还流程
用人单位需按照以下流程办理退还：
计算应退余额
从残疾人就业保障金月缴存额中扣除单位实际安排残疾人就业人数与应安排用人数的差额部分。
地方性政策调整
不同地区对退还比例和流程可能有所差异，需参照当地最新政策执行。
申请与发放
通过税务部门或指定渠道提交申请，税后余额一般按月发放给残疾人就业人员。
四、注意事项
政策差异： 具体退还比例可能因地区而异，建议咨询当地财政或税务部门。 申报时间
综上，协议就业保证金无需缴纳企业所得税或增值税，但需依法履行缴纳义务，并确保符合当地政策要求。