基础医学不能报考执业医师资格证的主要原因如下：
学历不作为医师资格依据 
根据《医师资格考试报名资格规定》，基础医学类、法医学类、护理学类等医学相关专业学历，不作为报考医师资格考试的学历依据。
无法通过执业医师资格考试
基础医学毕业生即使完成临床课程和实习，仍需重新参加3年规培才能行医，且无法直接报考该考试。
培养目标与临床要求不符
基础医学侧重理论研究，培养方向为“医学科学家”，而非临床实践，与临床医学专业存在本质差异，导致无法满足医院招聘医师的岗位要求。
就业与职业发展限制
该专业毕业生无法直接进入医院工作，就业方向集中于科研、高校、医药企业等，且硕士学历竞争力不足，多数岗位要求博士学历。
总结：
基础医学因学历限制、培养目标差异及职业路径狭窄，无法满足医师资格考试和临床岗位要求，因此不能报考。