就业协议作废流程如下：
登录系统并申请作废
进入系统，选择“申请纸质协议书”栏目中的“申请作废”。
填写申请理由，并上传证明材料。证明材料通常包括原单位同意解除协议的证明材料（加盖原单位公章）和新单位录用证明材料。
等待审核
提交材料后，等待学院审核。在审核通过前，可以撤销申请。
学院和学校审批
个人解约申请提交后，需经学院和学校审批通过。
解约流程
如果毕业生还未在协议上签字盖章，需要填写更改信息申请表，详细写明作废原因，并手写签名交给学校处理。
如果毕业生已在就业协议上签字，需要与用人单位进行解约，取得用人单位出具的解约函，再作废。
提交解约证明
将解约函及原就业协议提交至学校就业指导处，并及时跟进就业协议下发进度，以免耽误新公司签约。
核对新协议
拿到新协议后，核对个人信息及就业协议编号，如无问题及时与新录用公司联系签约。
建议：
在申请作废就业协议前，务必与原单位和学校充分沟通，确保流程顺畅。
准备好所有必要的证明材料，并按照系统要求上传。
在审核过程中，保持与学校和学院的沟通，及时跟进审核进度。