根据相关法律法规和搜索结果，灵活就业人员取消医保的办理方式主要有以下两种情况：
一、主动停保（适用于灵活就业人员自主选择停止缴纳）
确认参保状态 若灵活就业人员当前由单位缴纳社保，则需先确认单位是否已办理入职手续并开始缴费。若单位未参保，则无需通过单位办理停保。
准备材料
需携带身份证原件及复印件、银行卡等材料，部分地区可能需填写《停保申请表》。
提交申请
到当地社保局或医保中心提交材料并等待审核，通常需1-2个工作日。
办理结果
审核通过后，医保将停止缴纳，但个人账户可能保留一定余额（部分地区按缴费年限计算）。
二、转移或终止参保（适用于更换工作或完全退出）
转移参保
若更换工作单位且新单位继续缴纳社保，需向原参保地社保部门提交《参保缴费转移申请》，并办理转移手续。
完全终止参保
若确定不再缴纳医保，需向社保部门提交书面申请，说明取消原因（如就业状态变化）。部分地区需提供劳动合同终止证明等材料。
注销手续
审核通过后，社保部门将办理医保账户注销，社保卡将退还（部分城市需本人办理）。
注意事项
法律后果： 取消医保后，将无法享受医疗保险待遇，医疗费用需自费。 缴费年限影响
地区差异：具体流程和材料可能因地区政策不同存在差异，建议提前咨询当地社保部门。
建议根据自身实际情况选择合适方式，并确保材料齐全以缩短办理时间。