就业协议中的违约金计算需遵循《劳动合同法》及相关法律规定，具体分为以下两种情形：
一、服务期违约金
计算标准：
违约金=培训费÷约定服务年限×未履行年限（最高不超过培训费）
限制条件：
用人单位要求支付的违约金不得超过未履行服务期应分摊的培训费用
其他规定：
服务期期间工资可正常调整
二、竞业限制违约金
计算方式：
按约定支付违约金（通常按月支付）
补偿要求：
用人单位需在竞业限制期内按月支付经济补偿
三、通用原则
约定优先：
双方可协商确定违约金数额或计算方法
损失限制：
违约金不得低于实际损失，也不得过分高于实际损失（一般不超过30%）
司法调整：
若约定过高，可请求法院或仲裁机构适当减少
法律依据：《劳动合同法》第二十二条、第二十三条，《民法典》第五百八十五条