全国副部级学校共32所，均为985工程高校，具体名单如下：
一、中央部重点高校（14所）
1. 北京大学
2. 清华大学
3. 中国人民大学
4. 北京师范大学
5. 中国农业大学
6. 北京航空航天大学
7. 北京理工大学
8. 北京外国语大学
9. 北京师范大学
10. 中国科学技术大学
二、华东地区高校（7所）
1. 复旦大学
2. 上海交通大学
3. 南京大学
4. 浙江大学
5. 同济大学
6. 哈尔滨工业大学
7. 南开大学
三、华中地区高校（6所）
1. 武汉大学
2. 中山大学
3. 华中科技大学
4. 四川大学
5. 西安交通大学
6. 西北工业大学
四、其他省份高校（6所）
1. 天津大学
2. 湖北大学
3. 山东大学
4. 河南大学
5. 湖南大学
6. 东北大学
说明：
中国海洋大学、中央民族大学等7所985高校为正厅级，未列入副部级名单。- 副部级高校分三批设立：1992年首批14所、2000年增列7所、2003年增列11所。